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在東亞，年輕化和管腔(Luminal )亞型乳癌的發病率正在迅速攀升。年輕乳癌患者預後較差，病人之間高度的異質性及不同亞型的病因學、分子機制與治療結果皆對現今的精準醫學帶來了挑戰，傳統的標準醫療流程建議年輕女性乳腺癌更強的化療，但迄今管腔亞型仍沒有有效用藥指引。為了解決臨床未滿足需求，我們建構了一個深度蛋白質體與磷酸化蛋白質體分析流程，提供獨特的分子分群，解析管腔亞型乳癌的異質性、區分出早期乳癌高風險復發亞型及其癌化之特徵訊息傳遞路徑，並鑑定出此亞型的預測生物標誌物及建議潛在標靶治療。目前尚無相關商業競品可解析此管腔亞型乳癌病人之特異性，此方法將可發展高風險管腔亞型乳癌檢測工具，應用於早期乳癌的精準診斷與個人化用藥決策建議。